MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 5057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011982	CAG	2	6	256418	256423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080318
5002	NC_011982	TCCCC	2	10	256520	256529	0 %	20 %	0 %	80 %	222080319
5003	NC_011982	AAT	2	6	256556	256561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080319
5004	NC_011982	CGA	2	6	256622	256627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080319
5005	NC_011982	CCG	2	6	256702	256707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080319
5006	NC_011982	CTG	2	6	256779	256784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080319
5007	NC_011982	CTG	2	6	256788	256793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080319
5008	NC_011982	GCC	2	6	256818	256823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080319
5009	NC_011982	CGAG	2	8	256856	256863	25 %	0 %	50 %	25 %	222080319
5010	NC_011982	CTGTGA	2	12	256877	256888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222080319
5011	NC_011982	TCG	2	6	256922	256927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
5012	NC_011982	ATGA	2	8	256978	256985	50 %	25 %	25 %	0 %	222080320
5013	NC_011982	GAC	2	6	257026	257031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
5014	NC_011982	CCT	2	6	257055	257060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080320
5015	NC_011982	CCG	2	6	257147	257152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080320
5016	NC_011982	CAG	2	6	257176	257181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
5017	NC_011982	GCG	2	6	257189	257194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
5018	NC_011982	ATG	2	6	257216	257221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080320
5019	NC_011982	GAG	2	6	257251	257256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080320
5020	NC_011982	CGG	2	6	257304	257309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
5021	NC_011982	CGG	2	6	257322	257327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
5022	NC_011982	CGA	2	6	257367	257372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
5023	NC_011982	GAT	2	6	257380	257385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080320
5024	NC_011982	CGT	2	6	257398	257403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
5025	NC_011982	TCA	2	6	257487	257492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080320
5026	NC_011982	TCG	2	6	257510	257515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
5027	NC_011982	CGCC	2	8	257533	257540	0 %	0 %	25 %	75 %	222080320
5028	NC_011982	GCC	2	6	257599	257604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080320
5029	NC_011982	CGG	3	9	257688	257696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
5030	NC_011982	CGA	2	6	257778	257783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
5031	NC_011982	TCA	2	6	257792	257797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080320
5032	NC_011982	GGC	2	6	257891	257896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080321
5033	NC_011982	GTC	2	6	257901	257906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
5034	NC_011982	CGG	2	6	257928	257933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080321
5035	NC_011982	TCGG	2	8	257955	257962	0 %	25 %	50 %	25 %	222080321
5036	NC_011982	CGGCGA	2	12	257975	257986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222080321
5037	NC_011982	ACG	2	6	258001	258006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080321
5038	NC_011982	GC	3	6	258037	258042	0 %	0 %	50 %	50 %	222080321
5039	NC_011982	CGAAG	2	10	258056	258065	40 %	0 %	40 %	20 %	222080321
5040	NC_011982	TCG	2	6	258085	258090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
5041	NC_011982	GAT	2	6	258114	258119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080321
5042	NC_011982	CCT	2	6	258157	258162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080321
5043	NC_011982	CTC	2	6	258166	258171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080321
5044	NC_011982	GTC	2	6	258181	258186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
5045	NC_011982	GA	3	6	258231	258236	50 %	0 %	50 %	0 %	222080321
5046	NC_011982	CG	3	6	258301	258306	0 %	0 %	50 %	50 %	222080321
5047	NC_011982	ACC	2	6	258313	258318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080321
5048	NC_011982	TAGG	2	8	258346	258353	25 %	25 %	50 %	0 %	222080321
5049	NC_011982	CGT	2	6	258362	258367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
5050	NC_011982	CGC	2	6	258380	258385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080321
5051	NC_011982	CAA	3	9	258521	258529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_011982	GA	3	6	258538	258543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_011982	AATT	2	8	258682	258689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011982	TGC	2	6	258698	258703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_011982	A	6	6	258745	258750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011982	CTT	2	6	258769	258774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_011982	CAGC	2	8	258794	258801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.